ISAO kent beurzen toe die zich toespitsen op fundamenteel- en klinisch onderzoek naar de ziekte van Alzheimer en verwante vormen van dementie. De beurzen worden verleend op basis van het wetenschappelijk rendement van het ingediende onderzoek en de relevantie van het onderzoek voor de verbetering van het inzicht in de ziekte van Alzheimer. ISAO ondersteunt ook faciliteiten die van algemene invloed zijn op het fundamenteel onderzoek. Daarnaast kan zij voorzieningen aanbieden als
weefsel- en databanken, ten behoeve van wetenschappers over de hele wereld.
Om in aanmerking te komen voor een beurs dient een Nederlands wetenschappelijk instituut het onderzoek te steunen. De honorering daarvan vindt jaarlijks vanaf 31 oktober plaats, voor een periode van maximaal drie jaar en voor ten hoogste € 50.000 per jaar. Beurzen kunnen worden aangewend om een (post)promotie-stageplaats te financieren. Verlening van beurzen vindt plaats op basis van concurrerende beoordeling. Toegekende fondsen mogen uitsluitend voor onderzoek worden gebruikt. ISAO financiert geen overheadkosten van instituten, aanschaf van grote kapitaalintensieve apparatuur of aanbouw van gebouwen. ISAO verleent beurzen aan meer dan één onderzoeker van hetzelfde laboratorium, mits de ingediende projecten elkaar in wetenschappelijk opzicht niet overlappen. Met 'laboratorium' wordt het onderzoeksteam bedoeld dat werkt onder direct toezicht of directe begeleiding van een faculteitslid of onderzoeker. ISAO verleent geen wetenschappelijke onderzoeksbeurzen aan winstmakende organisaties. (zie ook: Subsidievoorwaarden en condities)
ISAO maakt gebruik van een systeem met concurrerende beoordeling, waarbij gebruik wordt gemaakt van een 2-stappenplan. De wetenschappelijke adviesraad, uitgebreid met een groep internationale Alzheimer-experts, doet haar aanbevelingen aan het bestuur van ISAO en dit bestuur neemt de uiteindelijke beslissing over de subsidieaanvragen. Degenen die een aanvraag hebben ingediend, krijgen schriftelijk bericht van de beslissing van het bestuur. Voordien mag het personeel van ISAO geen mededelingen doen over prioriteitsscores, rangorde of kans op het financieren van de aanvraag. (zie ook: Beoordeling aanvraag)